डॉक्टर एगमैन के साथ एक खतरनाक लड़ाई से ब्रह्मांड तबाह हो जाता है. इसके बाद, सॉनिक अपने दोस्तों के साथ फिर से जुड़ने और दुनिया को बचाने के लिए समानांतर आयामों के चक्कर लगाता है.